本校創於民國五十五年秋，校名為｢金門縣立金寧初級中學｣，斯時因校舍未建，於盤山村借租用民房，暫充教室，學生157人，班級數少，環境也侷促，端賴全校師生同心同德，篳路襤褸，共襄創校壯舉。

       五十六年九月新校舍落成，學生人數增為六班237人。五十七年全國實施九年國民教育，本校正式改名為『金門縣立金寧國民中小學』，合併古寧小學安美分班，學生人數為24班﹝國小部8班、國中部16班﹞986人。六十九年增設幼稚園二班，學生人數為1113人。本校自成立以來，經歷任校長呂水涵、蔡世炎、李養盛、翁志勵、陳昆仁、鄭啟超﹝二任﹞、楊清國、王世宗、楊瑞松、許維民、陳雅蘭諸 先生苦心擘劃，用心經營，校務蒸蒸日上，規模略具。

       現任校長 宋文法校長，自111學年接任後，珍視賢良績效，積極推展校務，提升教學、學務、輔導、總務績效，實踐『公、誠、勤、樸』的優質校風，戮力培養具備人文關懷、身心韌性、前瞻視野、終身學習、美學公民的領導人才。

目前共有幼兒園學生68名，國小學生98名，國中學生299名，共計學生465名。